Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FXNQ16595 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FXNQ16595 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FXNQ16595 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FXNQ16595 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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