Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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