Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VAMP3Q15836 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VAMP3Q15836 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VAMP3Q15836 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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VAMP3Q15836 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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