Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 KARS-204ENST00000564578 1942 ntTSL 512.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-215ENST00000497569 830 ntTSL 312.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MYO10-212ENST00000515803 4839 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLHL42-204ENST00000543254 772 ntTSL 212.17□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-261ENST00000568531 560 ntTSL 412.16□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-223ENST00000598067 543 ntTSL 512.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-210ENST00000479686 417 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-204ENST00000553952 710 ntTSL 212.08□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-203ENST00000593833 580 ntTSL 412.08□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-213ENST00000512878 483 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 512.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-208ENST00000444733 1725 ntTSL 312.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 L3MBTL2-206ENST00000466589 3055 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-202ENST00000448981 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SFT2D1-203ENST00000479490 2061 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MLXIP-209ENST00000539861 1384 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.496e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 212□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-220ENST00000597474 556 ntTSL 411.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LATS2-202ENST00000472754 495 ntTSL 311.95□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CARS2-221ENST00000540215 630 ntTSL 311.94□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-209ENST00000469380 321 ntTSL 211.92□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 311.92□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 211.91□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRUB2-202ENST00000460320 933 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRIM26-263ENST00000416596 1124 ntTSL 511.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAGK-223ENST00000524537 453 ntTSL 311.85□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-269ENST00000569101 734 ntTSL 311.79□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 211.79□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SARDH-208ENST00000469828 432 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-214ENST00000507904 465 ntTSL 211.75□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-204ENST00000465321 726 ntTSL 511.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-204ENST00000412774 562 ntTSL 211.71□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.68□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MED23-208ENST00000489888 745 ntTSL 311.67□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-202ENST00000411739 2490 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CERCAM-206ENST00000447915 530 ntTSL 511.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNAJC8-203ENST00000482674 721 ntTSL 211.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 IFT172-209ENST00000475909 402 ntTSL 511.56□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.565e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EARS2-214ENST00000564987 2870 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-201ENST00000366521 860 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-206ENST00000422595 902 ntTSL 511.52□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-204ENST00000563273 626 ntTSL 311.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-204ENST00000588654 541 ntTSL 411.47□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPA3-206ENST00000463632 793 ntTSL 511.45□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-213ENST00000497591 1201 ntTSL 511.44□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADAP1-210ENST00000477906 579 ntTSL 311.4□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VAT1-206ENST00000589709 570 ntTSL 411.4□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C1RL-AS1-205ENST00000541775 5272 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1671-204ENST00000461374 673 ntTSL 311.32□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-207ENST00000566560 1231 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 511.29□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 METTL13-206ENST00000478330 580 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MYO10-203ENST00000505695 4803 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GPAT4-204ENST00000519921 997 ntTSL 511.26□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-209ENST00000590049 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.26□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-203ENST00000546805 596 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-216ENST00000560232 1195 ntTSL 211.25□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VTI1A-204ENST00000480057 598 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UTP4-208ENST00000567015 690 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-223ENST00000583695 559 ntTSL 411.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 BAG6-256ENST00000462682 349 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-210ENST00000485612 701 ntTSL 211.15□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-267ENST00000568909 4254 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS1-205ENST00000537502 3509 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 41.9
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