Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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COL4A6Q14031 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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COL4A6Q14031 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A6Q14031 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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