Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms