Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms