Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD300CQ08708 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms