Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
EXOSC9Q06265 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms