Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IDH3AP50213 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms