Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms