Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD10P28358 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms