Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO2P25791 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO2P25791 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO2P25791 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO2P25791 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms