Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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ZBED1O96006 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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ZBED1O96006 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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ZBED1O96006 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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ZBED1O96006 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms