Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms