Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFDO43915 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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