Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms