Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.116e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PTPRG-205ENST00000475527 2694 ntTSL 521.37■■□□□ 1.013e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PTPRG-207ENST00000495879 3011 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.743e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 IDH1-202ENST00000415282 942 ntTSL 216.7■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 IDH1-203ENST00000415913 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-10■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.623e-10■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 522.5■■□□□ 1.191e-10■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.231e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-205ENST00000536738 824 ntTSL 326.82■■□□□ 1.881e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.841e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 TRIM47-207ENST00000593089 392 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-12■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-207ENST00000540129 1524 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 HS3ST3B1-202ENST00000466596 2808 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-208ENST00000542726 587 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-206ENST00000537945 795 ntTSL 311.43□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-204ENST00000536602 1008 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 WSB2-210ENST00000543218 935 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 214.72□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 214.47□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.852e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 321.94■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 521.54■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 515.89■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 324.64■■□□□ 1.543e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 224.48■■□□□ 1.513e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 323.88■■□□□ 1.413e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.263e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 317.31■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 514.85□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 514.77□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 512.87□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 312.57□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 311.72□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 315.32■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 ZFPL1-213ENST00000532200 802 ntTSL 27.2□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 IDNK-206ENST00000533522 1623 ntTSL 1 (best)25.53■■□□□ 1.682e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 GNA11-202ENST00000586180 739 ntTSL 323.68■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-203ENST00000480936 558 ntTSL 422.71■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K5-204ENST00000554273 484 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 419.09■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 GNA11-206ENST00000590534 2676 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TBC1D9B-213ENST00000521669 592 ntTSL 217.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-205ENST00000504637 548 ntTSL 517.04■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 417.01■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 FRAS1-204ENST00000508909 2297 ntTSL 216.9■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K5-209ENST00000557390 545 ntTSL 316.6■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NCOR2-219ENST00000474079 321 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 CDCA2-203ENST00000518225 464 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TCTEX1D2-203ENST00000446494 800 ntTSL 316.43■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 515.77■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SLBP-204ENST00000483348 1030 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■□ 21.6
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