Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBDO15205 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBDO15205 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBDO15205 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBDO15205 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBDO15205 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms