Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN2A8MW95 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms