Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms