Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNRGQ9UMZ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNRGQ9UMZ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms