Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2L1Q9P0L9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms