Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBP3Q9NS15 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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