Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms