Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 316.86■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.397e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 252.6
UTP3Q9NQZ2 DLG5-207ENST00000475613 7246 ntTSL 515.32■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 252.5
UTP3Q9NQZ2 LRPAP1-203ENST00000509198 1170 ntTSL 221.03■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 252.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 310.23□□□□□ -0.774e-13■■■■■ 251.9
UTP3Q9NQZ2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-12■■■■■ 251.7
UTP3Q9NQZ2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.532e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.172e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.143e-11■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-25■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.021e-25■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-208ENST00000481410 976 ntTSL 213.51□□□□□ -0.252e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-207ENST00000477820 531 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-206ENST00000472428 723 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.741e-25■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-208ENST00000539024 3414 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.922e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 C7orf49-204ENST00000459937 2576 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -12e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-221ENST00000606321 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.61□□□□□ -1.032e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-213ENST00000473813 944 ntTSL 35.63□□□□□ -1.512e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-201ENST00000302373 3097 ntTSL 1 (best)4.2□□□□□ -1.742e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH9-217ENST00000545556 3634 ntTSL 53.45□□□□□ -1.862e-13■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 251.5
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 251.4
UTP3Q9NQZ2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 251.1
UTP3Q9NQZ2 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-12■■■■■ 251
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 211.16□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 250.9
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-8■■■■■ 250.9
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 250.9
UTP3Q9NQZ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.317e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.187e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 DERL3-201ENST00000290730 3525 ntTSL 215.02□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 DERL3-205ENST00000464023 645 ntTSL 315.01□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 MGAT5B-206ENST00000565043 2923 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 MGAT5B-203ENST00000428789 4053 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.437e-8■■■■■ 250.8
UTP3Q9NQZ2 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 250.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-214ENST00000591293 645 ntTSL 320.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 250.5
UTP3Q9NQZ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-205ENST00000535477 2047 ntTSL 520.43■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-206ENST00000535990 2203 ntTSL 219.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 250.4
UTP3Q9NQZ2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 250.1
UTP3Q9NQZ2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 250.1
UTP3Q9NQZ2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 250.1
UTP3Q9NQZ2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 250.1
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 323.37■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 219.59■□□□□ 0.734e-33■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 ATXN1L-203ENST00000569119 428 ntTSL 518.31■□□□□ 0.524e-33■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 317.29■□□□□ 0.364e-33■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.654e-33■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-206ENST00000424441 1356 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.399e-14■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.831e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.751e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.741e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-202ENST00000579125 1318 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.251e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-211ENST00000424766 831 ntTSL 322.05■■□□□ 1.121e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.11e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 ADAM8-204ENST00000468964 613 ntTSL 520.98■□□□□ 0.951e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SHROOM1-205ENST00000488072 423 ntTSL 218.55■□□□□ 0.561e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-203ENST00000418996 703 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.391e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-209ENST00000510876 542 ntTSL 415.47■□□□□ 0.071e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-203ENST00000416543 995 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-201ENST00000342075 3012 ntTSL 215.17■□□□□ 0.021e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-226ENST00000553011 1037 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.021e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-214ENST00000591095 1097 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.041e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-212ENST00000590300 568 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-16■■■■■ 250
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