RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.19■■■□□ 2.74
PMS1-201ENST00000342075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-201ENST00000342075 ABCC9O60706 1549 aa27.12■■□□□ 1.93
PMS1-201ENST00000342075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-201ENST00000342075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-201ENST00000342075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-201ENST00000342075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.32■■□□□ 1.8
PMS1-201ENST00000342075 NACADO15069 1562 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-201ENST00000342075 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-201ENST00000342075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-201ENST00000342075 SCRIBQ14160 1630 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-201ENST00000342075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.78■■□□□ 1.72
PMS1-201ENST00000342075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PMS1-201ENST00000342075 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-201ENST00000342075 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-201ENST00000342075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PMS1-201ENST00000342075 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-201ENST00000342075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PMS1-201ENST00000342075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PMS1-201ENST00000342075 SMARCA4P51532 1647 aa24.84■■□□□ 1.57
PMS1-201ENST00000342075 WIZO95785 1651 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-201ENST00000342075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-201ENST00000342075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.5■■□□□ 1.51
PMS1-201ENST00000342075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-201ENST00000342075 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-201ENST00000342075 SMARCA2P51531 1590 aa24.39■■□□□ 1.5
PMS1-201ENST00000342075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-201ENST00000342075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PMS1-201ENST00000342075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.29■■□□□ 1.48
PMS1-201ENST00000342075 NCAPD3P42695 1498 aa24.27■■□□□ 1.48
PMS1-201ENST00000342075 HMGXB3Q12766 1538 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-201ENST00000342075 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-201ENST00000342075 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-201ENST00000342075 NESP48681 1621 aa23.75■■□□□ 1.39
PMS1-201ENST00000342075 ABCC8Q09428 1581 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-201ENST00000342075 CFTRP13569 1480 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-201ENST00000342075 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-201ENST00000342075 PRDM2Q13029 1718 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-201ENST00000342075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-201ENST00000342075 TRIM41Q8WV44 630 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-201ENST00000342075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-201ENST00000342075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
PMS1-201ENST00000342075 SYNJ1O43426 1573 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-201ENST00000342075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-201ENST00000342075 CUX1P39880 1505 aa23.34■■□□□ 1.33
PMS1-201ENST00000342075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.32■■□□□ 1.32
PMS1-201ENST00000342075 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-201ENST00000342075 TOP2BQ02880 1626 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-201ENST00000342075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-201ENST00000342075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-201ENST00000342075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-201ENST00000342075 ERCC6Q03468 1493 aa23.2■■□□□ 1.31
PMS1-201ENST00000342075 TOPBP1Q92547 1522 aa23.17■■□□□ 1.3
PMS1-201ENST00000342075 SOGA1O94964 1423 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-201ENST00000342075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-201ENST00000342075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-201ENST00000342075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-201ENST00000342075 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.08■■□□□ 1.29
PMS1-201ENST00000342075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.06■■□□□ 1.28
PMS1-201ENST00000342075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PMS1-201ENST00000342075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.05■■□□□ 1.28
PMS1-201ENST00000342075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PMS1-201ENST00000342075 WDR62O43379 1518 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-201ENST00000342075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-201ENST00000342075 CUX2O14529 1486 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-201ENST00000342075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-201ENST00000342075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-201ENST00000342075 WDR97A6NE52 1622 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-201ENST00000342075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-201ENST00000342075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-201ENST00000342075 KIF27Q86VH2 1401 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-201ENST00000342075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-201ENST00000342075 EEA1Q15075 1411 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-201ENST00000342075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.231e-9■■■■□ 22.4
PMS1-201ENST00000342075 IFT140Q96RY7 1462 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-201ENST00000342075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-201ENST00000342075 IGF1RP08069 1367 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-201ENST00000342075 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-201ENST00000342075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-201ENST00000342075 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PMS1-201ENST00000342075 PBRM1Q86U86 1689 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-201ENST00000342075 PRXQ9BXM0 1461 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-201ENST00000342075 KIF21BO75037 1637 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-201ENST00000342075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PMS1-201ENST00000342075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-201ENST00000342075 GOLGA3Q08378 1498 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-201ENST00000342075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-201ENST00000342075 GRIN2BQ13224 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-201ENST00000342075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-201ENST00000342075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-201ENST00000342075 CUL7Q14999 1698 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-201ENST00000342075 ADAMTS12P58397 1594 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-201ENST00000342075 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-201ENST00000342075 FBLN2P98095 1184 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-201ENST00000342075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-201ENST00000342075 CEP162Q5TB80 1403 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-201ENST00000342075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-201ENST00000342075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-201ENST00000342075 SYNJ2O15056 1496 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-201ENST00000342075 GRIN2AQ12879 1464 aa22.28■■□□□ 1.16
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