RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.3■■■■■ 5.48
PMS1-211ENST00000424766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.67■■■■■ 4.58
PMS1-211ENST00000424766 ABCC9O60706 1549 aa42.28■■■■■ 4.36
PMS1-211ENST00000424766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
PMS1-211ENST00000424766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.03■■■■■ 4.16
PMS1-211ENST00000424766 NACADO15069 1562 aa40.97■■■■■ 4.15
PMS1-211ENST00000424766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.91■■■■■ 4.14
PMS1-211ENST00000424766 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.88■■■■■ 4.13
PMS1-211ENST00000424766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.84■■■■■ 4.13
PMS1-211ENST00000424766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40■■■■□ 3.99
PMS1-211ENST00000424766 SCRIBQ14160 1630 aa39.81■■■■□ 3.96
PMS1-211ENST00000424766 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.63■■■■□ 3.93
PMS1-211ENST00000424766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.59■■■■□ 3.93
PMS1-211ENST00000424766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.27■■■■□ 3.88
PMS1-211ENST00000424766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
PMS1-211ENST00000424766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.47■■■■□ 3.75
PMS1-211ENST00000424766 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.34■■■■□ 3.73
PMS1-211ENST00000424766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.3■■■■□ 3.72
PMS1-211ENST00000424766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
PMS1-211ENST00000424766 SMARCA4P51532 1647 aa38.16■■■■□ 3.7
PMS1-211ENST00000424766 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.98■■■■□ 3.67
PMS1-211ENST00000424766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.85■■■■□ 3.65
PMS1-211ENST00000424766 SMARCA2P51531 1590 aa37.85■■■■□ 3.65
PMS1-211ENST00000424766 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.8■■■■□ 3.64
PMS1-211ENST00000424766 NCAPD3P42695 1498 aa37.79■■■■□ 3.64
PMS1-211ENST00000424766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
PMS1-211ENST00000424766 HMGXB3Q12766 1538 aa37.62■■■■□ 3.61
PMS1-211ENST00000424766 WIZO95785 1651 aa37.6■■■■□ 3.61
PMS1-211ENST00000424766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
PMS1-211ENST00000424766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
PMS1-211ENST00000424766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
PMS1-211ENST00000424766 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.8■■■■□ 3.48
PMS1-211ENST00000424766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.73■■■■□ 3.47
PMS1-211ENST00000424766 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.71■■■■□ 3.47
PMS1-211ENST00000424766 NESP48681 1621 aa36.7■■■■□ 3.47
PMS1-211ENST00000424766 CFTRP13569 1480 aa36.56■■■■□ 3.44
PMS1-211ENST00000424766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
PMS1-211ENST00000424766 ERCC6Q03468 1493 aa36.42■■■■□ 3.42
PMS1-211ENST00000424766 PRDM2Q13029 1718 aa36.37■■■■□ 3.41
PMS1-211ENST00000424766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.32■■■■□ 3.4
PMS1-211ENST00000424766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.26■■■■□ 3.4
PMS1-211ENST00000424766 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.18■■■■□ 3.38
PMS1-211ENST00000424766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PMS1-211ENST00000424766 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.04■■■■□ 3.36
PMS1-211ENST00000424766 CUX2O14529 1486 aa35.92■■■■□ 3.34
PMS1-211ENST00000424766 WDR62O43379 1518 aa35.9■■■■□ 3.34
PMS1-211ENST00000424766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
PMS1-211ENST00000424766 ABCC8Q09428 1581 aa35.81■■■■□ 3.32
PMS1-211ENST00000424766 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
PMS1-211ENST00000424766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.73■■■■□ 3.31
PMS1-211ENST00000424766 CUX1P39880 1505 aa35.6■■■■□ 3.29
PMS1-211ENST00000424766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.54■■■■□ 3.28
PMS1-211ENST00000424766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 TOP2BQ02880 1626 aa35.43■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.43■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.41■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 IFT140Q96RY7 1462 aa35.41■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 SYNJ1O43426 1573 aa35.4■■■■□ 3.26
PMS1-211ENST00000424766 SOGA1O94964 1423 aa35.34■■■■□ 3.25
PMS1-211ENST00000424766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
PMS1-211ENST00000424766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.28■■■■□ 3.24
PMS1-211ENST00000424766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PMS1-211ENST00000424766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.12■■■■□ 3.21
PMS1-211ENST00000424766 WDR97A6NE52 1622 aa35.11■■■■□ 3.21
PMS1-211ENST00000424766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PMS1-211ENST00000424766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
PMS1-211ENST00000424766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PMS1-211ENST00000424766 TRIM41Q8WV44 630 aa35.01■■■■□ 3.2
PMS1-211ENST00000424766 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.93■■■■□ 3.18
PMS1-211ENST00000424766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.92■■■■□ 3.18
PMS1-211ENST00000424766 GRIN2BQ13224 1484 aa34.87■■■■□ 3.17
PMS1-211ENST00000424766 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.85■■■■□ 3.17
PMS1-211ENST00000424766 PBRM1Q86U86 1689 aa34.82■■■■□ 3.17
PMS1-211ENST00000424766 KIF27Q86VH2 1401 aa34.78■■■■□ 3.16
PMS1-211ENST00000424766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
PMS1-211ENST00000424766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.72■■■■□ 3.15
PMS1-211ENST00000424766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.71■■■■□ 3.15
PMS1-211ENST00000424766 IGF1RP08069 1367 aa34.61■■■■□ 3.13
PMS1-211ENST00000424766 SYNJ2O15056 1496 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-211ENST00000424766 CHD1O14646 1710 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-211ENST00000424766 FBLN2P98095 1184 aa34.57■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.55■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 OSCARQ8IYS5 282 aa34.55■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.55■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS12P58397 1594 aa34.54■■■■□ 3.12
PMS1-211ENST00000424766 CUL7Q14999 1698 aa34.48■■■■□ 3.11
PMS1-211ENST00000424766 EEA1Q15075 1411 aa34.41■■■■□ 3.1
PMS1-211ENST00000424766 GRIN2AQ12879 1464 aa34.4■■■■□ 3.1
PMS1-211ENST00000424766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.4■■■■□ 3.1
PMS1-211ENST00000424766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.37■■■■□ 3.09
PMS1-211ENST00000424766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.32■■■■□ 3.08
PMS1-211ENST00000424766 NUP160Q12769 1436 aa34.24■■■■□ 3.07
PMS1-211ENST00000424766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.24■■■■□ 3.07
PMS1-211ENST00000424766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PMS1-211ENST00000424766 PRXQ9BXM0 1461 aa34.2■■■■□ 3.07
PMS1-211ENST00000424766 CEP170Q5SW79 1584 aa34.2■■■■□ 3.07
PMS1-211ENST00000424766 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.2■■■■□ 3.06
PMS1-211ENST00000424766 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.04■■■■□ 3.04
PMS1-211ENST00000424766 KIF21BO75037 1637 aa33.99■■■■□ 3.03
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