Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms