Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AFF1-208ENST00000511722 638 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 INTS1-204ENST00000482994 498 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-229ENST00000567059 509 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RABGEF1-204ENST00000442563 553 ntTSL 415.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.087e-17■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-221ENST00000514677 986 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPP1R16A-206ENST00000528430 807 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-213ENST00000551625 2450 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EXOC6B-203ENST00000410112 1372 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOR2A-206ENST00000472723 3496 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-206ENST00000485560 1705 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-222ENST00000636280 2462 ntTSL 515.27■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-208ENST00000561524 577 ntTSL 415.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-228ENST00000566975 580 ntTSL 415.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-211ENST00000558748 657 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-218ENST00000513723 923 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-210ENST00000562503 737 ntTSL 414.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-212ENST00000551598 636 ntTSL 514.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-210ENST00000557502 803 ntTSL 514.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-209ENST00000507008 692 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-207ENST00000548602 1666 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-226ENST00000566648 651 ntTSL 314.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPP1R16A-203ENST00000526183 4311 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-215ENST00000565551 645 ntTSL 514.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-211ENST00000557710 1751 ntTSL 1 (best)14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-229ENST00000561038 2160 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.187e-17■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-209ENST00000555865 739 ntTSL 313.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-230ENST00000567204 516 ntTSL 413.48□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-232ENST00000569112 564 ntTSL 413.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-209ENST00000529476 581 ntTSL 313.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KLHL36-202ENST00000325279 6488 ntTSL 213.05□□□□□ -0.321e-11■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-212ENST00000562984 551 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-205ENST00000473969 1092 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EVI5-202ENST00000466778 321 ntTSL 312.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.447e-17■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 33
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