Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8Q15843 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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