Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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