Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 518.03■□□□□ 0.482e-6■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.897e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.827e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 514.29□□□□□ -0.127e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.91□□□□□ -0.347e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-204ENST00000461641 936 ntTSL 512.56□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.62□□□□□ -1.037e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 58.26□□□□□ -1.097e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 56.61□□□□□ -1.357e-7■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.179e-12■□□□□ 10.5
HLTFQ14527 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.945e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.89e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-205ENST00000537237 1296 ntTSL 528.41■■■□□ 2.148e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.068e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 226.83■■□□□ 1.898e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.558e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 517.88■□□□□ 0.458e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.318e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 516.09■□□□□ 0.178e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.18e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.288e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 211.67□□□□□ -0.548e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-9■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.893e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.453e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MIA3-209ENST00000476400 435 ntTSL 32.44□□□□□ -2.023e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.423e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 AGAP1-209ENST00000453371 2138 ntTSL 519.24■□□□□ 0.672e-8■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 AGAP1-210ENST00000466575 541 ntTSL 314.78□□□□□ -0.042e-8■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 LYPLAL1-207ENST00000475724 1715 ntTSL 35.57□□□□□ -1.523e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.532e-8■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 FTX-218ENST00000641360 3897 nt5.15□□□□□ -1.582e-8■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.897e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 38.09□□□□□ -1.117e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 NEDD9-204ENST00000448183 4934 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.972e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.154e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.824e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC10.72□□□□□ -0.694e-67■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-67■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.086e-8■□□□□ 10.4
HLTFQ14527 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 525.41■■□□□ 1.661e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 421.77■■□□□ 1.081e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 418.97■□□□□ 0.631e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.631e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 56.74□□□□□ -1.331e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.341e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.86e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.934e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 OPN3-204ENST00000469376 1961 ntTSL 1 (best)28.13■■■□□ 2.093e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 OPN3-205ENST00000478849 880 ntTSL 324.49■■□□□ 1.513e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.433e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)22.76■■□□□ 1.233e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 OPN3-203ENST00000463155 806 ntTSL 37.42□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.331e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.541e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-207ENST00000554090 543 ntTSL 54.73□□□□□ -1.651e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.961e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 NKTR-217ENST00000498730 4912 ntTSL 24.01□□□□□ -1.776e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 29.64□□□□□ -0.871e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 212.53□□□□□ -0.48e-7■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 224.74■■□□□ 1.558e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.848e-8■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.786e-9■□□□□ 10.3
HLTFQ14527 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.281e-6■□□□□ 10.3
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