Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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