Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 RPL27A-207ENST00000530585 577 ntTSL 210.8□□□□□ -0.682e-37■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 COX7A2L-207ENST00000482463 1918 ntTSL 212.42□□□□□ -0.422e-9■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 COX7A2L-206ENST00000468711 516 ntTSL 310.69□□□□□ -0.72e-9■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.324e-7■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.566e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.036e-8■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 NT5C3B-204ENST00000445655 922 ntTSL 225.81■■□□□ 1.726e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 NT5C3B-209ENST00000476921 1081 ntTSL 325.69■■□□□ 1.76e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 CENPV-203ENST00000476243 1770 ntTSL 524.5■■□□□ 1.516e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-208ENST00000567530 1796 ntTSL 523.94■■□□□ 1.426e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.356e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.196e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.136e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.116e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.096e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 221.79■■□□□ 1.086e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-208ENST00000529742 733 ntTSL 220.41■□□□□ 0.866e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.746e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-202ENST00000524647 1817 ntTSL 519.18■□□□□ 0.666e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-207ENST00000566568 2558 ntTSL 517.79■□□□□ 0.446e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-216ENST00000533519 694 ntTSL 216.71■□□□□ 0.276e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-210ENST00000567682 439 ntTSL 315.92■□□□□ 0.146e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 DPM2-204ENST00000473360 744 ntTSL 515.75■□□□□ 0.116e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 215.6■□□□□ 0.096e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.046e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.246e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-214ENST00000531905 3420 ntTSL 512.7□□□□□ -0.386e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.596e-7■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.696e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 CENPV-202ENST00000472570 554 ntTSL 210.53□□□□□ -0.726e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.826e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 MUS81-203ENST00000525006 434 ntTSL 37.39□□□□□ -1.236e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 VPS33B-207ENST00000557470 529 ntTSL 57.23□□□□□ -1.256e-11■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 PSTPIP2-203ENST00000588801 1023 ntTSL 519.76■□□□□ 0.756e-10■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-10■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.456e-10■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-230ENST00000488543 2484 ntTSL 213.53□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 HDAC6-207ENST00000430858 618 ntTSL 311.79□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 AKR1A1-207ENST00000475985 335 ntTSL 25.21□□□□□ -1.587e-13■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-8■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-8■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-8■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.62e-16■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 222.86■■□□□ 1.252e-16■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 217.43■□□□□ 0.382e-16■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-16■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.71□□□□□ -0.532e-16■■■■□ 25.6
PABPC4Q13310 ELOC-210ENST00000622804 1976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.54e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-222ENST00000576677 1926 ntTSL 1 (best)24.46■■□□□ 1.512e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-209ENST00000572794 1380 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-208ENST00000572389 776 ntTSL 220.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-223ENST00000576691 929 ntTSL 319.58■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-220ENST00000576432 684 ntTSL 218.28■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-226ENST00000577051 979 ntTSL 517.3■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 231.56■■■□□ 2.645e-13■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 FUNDC2-202ENST00000456179 871 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 METTL26-213ENST00000568830 590 ntTSL 322.64■■□□□ 1.215e-10■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.089e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.189e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 MRPS27-206ENST00000515226 4435 ntTSL 26.71□□□□□ -1.339e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.687e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 EML2-206ENST00000586405 630 ntTSL 319.37■□□□□ 0.697e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 EML2-227ENST00000592433 705 ntTSL 218.26■□□□□ 0.517e-7■■■■□ 25.5
PABPC4Q13310 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RTFDC1-207ENST00000477573 2193 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.153e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 FAM209A-202ENST00000481560 666 ntTSL 57.64□□□□□ -1.193e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 FXR1-216ENST00000482125 739 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)24.02■■□□□ 1.447e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.127e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 316.42■□□□□ 0.227e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.417e-9■■■■□ 25.4
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