Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ID3Q02535 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ID3Q02535 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ID3Q02535 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms