Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms