Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms