Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2P10911 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2P10911 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCF2P10911 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2P10911 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2P10911 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2P10911 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms