Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA1P02708 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA1P02708 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms