Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
J3KT08 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
J3KT08 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
J3KT08 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
J3KT08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3KT08 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms