Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms