Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.362e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)28.97■■■□□ 2.232e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.92e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.831e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.393e-6■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-15■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 GOLGA8A-203ENST00000473125 6233 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.474e-15■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 AC131212.2-201ENST00000622917 1355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 21.7
DROSHAQ9NRR4 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-27■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 425.07■■□□□ 1.61e-6■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 336.36■■■■□ 3.414e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-209ENST00000434453 2229 ntTSL 536.16■■■■□ 3.384e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 334.07■■■■□ 3.044e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 532.74■■■□□ 2.834e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 232.74■■■□□ 2.834e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 432.74■■■□□ 2.834e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-207ENST00000433968 578 ntTSL 432.74■■■□□ 2.834e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-203ENST00000414218 451 ntTSL 531.96■■■□□ 2.714e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-219ENST00000498034 478 ntTSL 331.6■■■□□ 2.654e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-208ENST00000434278 678 ntTSL 531.02■■■□□ 2.564e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 226.78■■□□□ 1.884e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.684e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.032e-9■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.22e-9■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 526.6■■□□□ 1.852e-9■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 525.5■■□□□ 1.672e-9■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.716e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.526e-7■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 ESRRA-205ENST00000468670 742 ntTSL 232.2■■■□□ 2.752e-6■■■■□ 21.6
DROSHAQ9NRR4 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.713e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 221.9■■□□□ 1.12e-10■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 LINC01606-204ENST00000519241 509 ntTSL 329.76■■■□□ 2.352e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 320.01■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 525.67■■□□□ 1.79e-7■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 227.74■■■□□ 2.033e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.913e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.813e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 525.84■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.473e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.433e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 523.94■■□□□ 1.423e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.353e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 222.01■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 221.3■■□□□ 13e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 220.19■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-8■■■■□ 21.5
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.882e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 225.52■■□□□ 1.682e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.592e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.582e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-218ENST00000569787 727 ntTSL 320.62■□□□□ 0.892e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-216ENST00000591474 845 ntTSL 335.69■■■■□ 3.32e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.871e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-207ENST00000586837 838 ntTSL 530.38■■■□□ 2.452e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-211ENST00000589548 849 ntTSL 328.9■■■□□ 2.222e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.212e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.192e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.132e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-202ENST00000528070 856 ntTSL 527.7■■■□□ 2.021e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.952e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.832e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-206ENST00000568402 540 ntTSL 422.55■■□□□ 1.25e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 222.42■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 521.44■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.645e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-205ENST00000530440 710 ntTSL 318.28■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 214.97□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-215ENST00000493638 715 ntTSL 35.39□□□□□ -1.555e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 53.74□□□□□ -1.812e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PLXNA3-208ENST00000495040 421 ntTSL 541.09■■■■■ 4.171e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 339.58■■■■□ 3.933e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 537.62■■■■□ 3.613e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 537.49■■■■□ 3.593e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.53e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 536.4■■■■□ 3.423e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-210ENST00000450533 2451 ntTSL 1 (best)31.94■■■□□ 2.73e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.093e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 523.43■■□□□ 1.343e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 521.73■■□□□ 1.073e-9■■■■□ 21.4
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