Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms