Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPQ96QV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms