Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD1Q96MW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD1Q96MW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms