Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FSIP1Q8NA03 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms