Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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