Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE27Q5T4F4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms