Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFHC1Q5JVL4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHC1Q5JVL4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms